Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C2orf54Q08AI8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms