Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSM1Q08AH1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM1Q08AH1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM1Q08AH1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms