Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPOCK1Q08629 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPOCK1Q08629 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPOCK1Q08629 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms