Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF11Q05519 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF11Q05519 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms