Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTK2Q05397 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTK2Q05397 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms