Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID5AQ03989 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms