Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PAX5Q02548 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms