Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HSF1Q00613 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HSF1Q00613 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms