Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK6Q00534 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms