Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSBP2P81877 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSBP2P81877 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms