Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUCB2P80303 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NUCB2P80303 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUCB2P80303 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms