Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX6P78412 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX6P78412 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX6P78412 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX6P78412 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX6P78412 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX6P78412 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX6P78412 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX6P78412 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX6P78412 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX6P78412 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX6P78412 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRX6P78412 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX6P78412 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX6P78412 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX6P78412 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX6P78412 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX6P78412 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX6P78412 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX6P78412 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX6P78412 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX6P78412 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX6P78412 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX6P78412 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX6P78412 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX6P78412 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX6P78412 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX6P78412 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX6P78412 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX6P78412 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX6P78412 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX6P78412 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX6P78412 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX6P78412 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX6P78412 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX6P78412 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX6P78412 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX6P78412 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX6P78412 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX6P78412 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX6P78412 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX6P78412 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX6P78412 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX6P78412 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX6P78412 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX6P78412 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX6P78412 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX6P78412 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX6P78412 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX6P78412 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX6P78412 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX6P78412 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX6P78412 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX6P78412 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX6P78412 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX6P78412 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX6P78412 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX6P78412 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX6P78412 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX6P78412 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms