Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN10P78369 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN10P78369 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN10P78369 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms