Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBG1P69891 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBG1P69891 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBG1P69891 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBG1P69891 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HBG1P69891 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HBG1P69891 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HBG1P69891 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HBG1P69891 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HBG1P69891 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HBG1P69891 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HBG1P69891 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HBG1P69891 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HBG1P69891 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms