Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX1P67809 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX1P67809 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX1P67809 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YBX1P67809 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YBX1P67809 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YBX1P67809 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YBX1P67809 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBX1P67809 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBX1P67809 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBX1P67809 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBX1P67809 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBX1P67809 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBX1P67809 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YBX1P67809 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YBX1P67809 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBX1P67809 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBX1P67809 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms