Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SUMO1P63165 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SUMO1P63165 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms