Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP46P62068 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP46P62068 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP46P62068 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP46P62068 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP46P62068 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP46P62068 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP46P62068 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP46P62068 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP46P62068 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP46P62068 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP46P62068 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP46P62068 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP46P62068 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP46P62068 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP46P62068 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP46P62068 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP46P62068 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP46P62068 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP46P62068 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP46P62068 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP46P62068 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP46P62068 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP46P62068 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP46P62068 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP46P62068 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP46P62068 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP46P62068 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP46P62068 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP46P62068 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP46P62068 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP46P62068 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP46P62068 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP46P62068 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP46P62068 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP46P62068 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP46P62068 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP46P62068 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP46P62068 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP46P62068 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP46P62068 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP46P62068 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP46P62068 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP46P62068 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP46P62068 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP46P62068 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP46P62068 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP46P62068 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP46P62068 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP46P62068 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP46P62068 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP46P62068 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP46P62068 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP46P62068 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP46P62068 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP46P62068 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP46P62068 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms