Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPS2P61201 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPS2P61201 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPS2P61201 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS2P61201 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS2P61201 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS2P61201 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPS2P61201 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPS2P61201 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPS2P61201 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPS2P61201 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPS2P61201 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS2P61201 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS2P61201 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS2P61201 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS2P61201 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS2P61201 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPS2P61201 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPS2P61201 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS2P61201 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS2P61201 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS2P61201 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS2P61201 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS2P61201 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPS2P61201 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS2P61201 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPS2P61201 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms