Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVFRD-1P60508 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVFRD-1P60508 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms