Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERVFC1P60507 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVFC1P60507 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVFC1P60507 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms