Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LOXL3P58215 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LOXL3P58215 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms