Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCBP4P57723 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PCBP4P57723 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCBP4P57723 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms