Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC8A3P57103 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC8A3P57103 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms