Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAV3P56539 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAV3P56539 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAV3P56539 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAV3P56539 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAV3P56539 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAV3P56539 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAV3P56539 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV3P56539 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV3P56539 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV3P56539 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV3P56539 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV3P56539 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV3P56539 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAV3P56539 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV3P56539 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV3P56539 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV3P56539 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV3P56539 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV3P56539 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAV3P56539 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV3P56539 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV3P56539 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV3P56539 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAV3P56539 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAV3P56539 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CAV3P56539 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CAV3P56539 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CAV3P56539 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms