Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP1S2P56377 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP1S2P56377 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms