Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH4P55283 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH4P55283 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH4P55283 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH4P55283 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH4P55283 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH4P55283 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH4P55283 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH4P55283 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH4P55283 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH4P55283 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH4P55283 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH4P55283 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH4P55283 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH4P55283 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH4P55283 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH4P55283 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH4P55283 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH4P55283 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH4P55283 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH4P55283 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH4P55283 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH4P55283 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH4P55283 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH4P55283 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH4P55283 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH4P55283 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDH4P55283 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDH4P55283 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH4P55283 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH4P55283 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH4P55283 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH4P55283 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH4P55283 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH4P55283 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH4P55283 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH4P55283 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH4P55283 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH4P55283 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH4P55283 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH4P55283 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH4P55283 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH4P55283 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH4P55283 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH4P55283 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms