Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRPF1P55201 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRPF1P55201 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms