Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YARSP54577 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YARSP54577 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YARSP54577 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YARSP54577 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YARSP54577 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YARSP54577 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
YARSP54577 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YARSP54577 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YARSP54577 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YARSP54577 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
YARSP54577 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YARSP54577 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YARSP54577 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YARSP54577 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YARSP54577 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YARSP54577 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YARSP54577 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YARSP54577 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YARSP54577 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
YARSP54577 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YARSP54577 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YARSP54577 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YARSP54577 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YARSP54577 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YARSP54577 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YARSP54577 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YARSP54577 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YARSP54577 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YARSP54577 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
YARSP54577 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
YARSP54577 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YARSP54577 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YARSP54577 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YARSP54577 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YARSP54577 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YARSP54577 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
YARSP54577 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
YARSP54577 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
YARSP54577 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YARSP54577 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
YARSP54577 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YARSP54577 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
YARSP54577 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
YARSP54577 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
YARSP54577 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
YARSP54577 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms