Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNB3P54284 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNB3P54284 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms