Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSCP53634 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSCP53634 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSCP53634 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSCP53634 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTSCP53634 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTSCP53634 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSCP53634 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSCP53634 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSCP53634 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSCP53634 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSCP53634 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTSCP53634 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTSCP53634 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTSCP53634 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTSCP53634 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTSCP53634 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTSCP53634 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSCP53634 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms