Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARFIP2P53365 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFIP2P53365 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms