Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCNKBP51801 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCNKBP51801 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms