Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCNN1GP51170 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCNN1GP51170 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms