Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAMP50895 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAMP50895 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAMP50895 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAMP50895 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAMP50895 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAMP50895 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAMP50895 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAMP50895 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAMP50895 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAMP50895 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAMP50895 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAMP50895 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAMP50895 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCAMP50895 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCAMP50895 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCAMP50895 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAMP50895 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAMP50895 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAMP50895 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAMP50895 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAMP50895 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAMP50895 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAMP50895 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAMP50895 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAMP50895 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAMP50895 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAMP50895 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAMP50895 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAMP50895 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCAMP50895 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAMP50895 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAMP50895 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAMP50895 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAMP50895 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAMP50895 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAMP50895 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCAMP50895 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BCAMP50895 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAMP50895 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAMP50895 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAMP50895 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAMP50895 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCAMP50895 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCAMP50895 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms