Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSEN2P49810 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSEN2P49810 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms