Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRIM1P49642 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRIM1P49642 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms