Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC11A1P49279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC11A1P49279 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC11A1P49279 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms