Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ME1P48163 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME1P48163 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME1P48163 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME1P48163 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME1P48163 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME1P48163 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME1P48163 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ME1P48163 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ME1P48163 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ME1P48163 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME1P48163 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME1P48163 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME1P48163 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ME1P48163 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ME1P48163 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ME1P48163 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ME1P48163 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME1P48163 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ME1P48163 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME1P48163 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME1P48163 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME1P48163 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ME1P48163 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME1P48163 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME1P48163 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME1P48163 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME1P48163 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms