Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR1P43307 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR1P43307 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR1P43307 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR1P43307 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR1P43307 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR1P43307 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR1P43307 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSR1P43307 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR1P43307 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR1P43307 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR1P43307 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR1P43307 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSR1P43307 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSR1P43307 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSR1P43307 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR1P43307 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR1P43307 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms