Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL35P42766 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL35P42766 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL35P42766 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL35P42766 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL35P42766 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL35P42766 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms