Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PI4KAP42356 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PI4KAP42356 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms