Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ELK3P41970 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ELK3P41970 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ELK3P41970 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ELK3P41970 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK3P41970 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK3P41970 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK3P41970 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK3P41970 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ELK3P41970 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ELK3P41970 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ELK3P41970 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ELK3P41970 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK3P41970 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK3P41970 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ELK3P41970 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms