Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFSF9P41273 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFSF9P41273 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFSF9P41273 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms