Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPA9P38646 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSPA9P38646 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPA9P38646 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.6 ms