Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPAP38571 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPAP38571 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPAP38571 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPAP38571 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPAP38571 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPAP38571 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPAP38571 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPAP38571 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPAP38571 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPAP38571 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPAP38571 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPAP38571 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPAP38571 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPAP38571 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPAP38571 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPAP38571 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIPAP38571 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIPAP38571 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIPAP38571 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIPAP38571 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPAP38571 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPAP38571 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPAP38571 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPAP38571 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPAP38571 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPAP38571 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPAP38571 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPAP38571 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPAP38571 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPAP38571 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPAP38571 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPAP38571 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPAP38571 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPAP38571 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPAP38571 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPAP38571 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPAP38571 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms