Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACVRL1P37023 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACVRL1P37023 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVRL1P37023 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms