Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL4P36578 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL4P36578 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL4P36578 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL4P36578 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL4P36578 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL4P36578 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL4P36578 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL4P36578 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL4P36578 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL4P36578 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL4P36578 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL4P36578 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL4P36578 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms