Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP214P35658 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP214P35658 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP214P35658 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP214P35658 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP214P35658 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP214P35658 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP214P35658 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP214P35658 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP214P35658 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP214P35658 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP214P35658 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP214P35658 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP214P35658 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP214P35658 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP214P35658 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP214P35658 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP214P35658 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP214P35658 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms