Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFTPDP35247 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SFTPDP35247 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms