Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HSPA4P34932 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HSPA4P34932 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms